Renseignements d'identification

Année d'études :
Master 4

Acronyme :
TLU41MIC

Nombre de crédits ECTS :
5 (Facteur de pondération)

Volume horaire :
71h

Liste des activités d'apprentissage:

Contribution de l'UE au profil d'enseignement du programme :

Au terme de sa formation, le Master en Master en Sciences de l'Ingénieur Industriel est capable de :

• ARES. 1 01. Identifier, conceptualiser et résoudre des problèmes complexes
• ARES. 1.1 Intégrer les savoirs scientifiques et technologiques afin de faire face à la diversité et à la complexité des problèmes rencontrés
• ARES. 1.6 Établir ou concevoir un protocole de tests, de contrôles et de mesures.
• ARES. 2 02. Concevoir et gérer des projets de recherche appliquée
• ARES. 2.3 Mener des études expérimentales, en évaluer les résultats et en tirer des conclusions
• ARES. 2.5 Exploiter les résultats de recherche
• ARES. 3 03. Développer et appliquer les ressources techniques et technologiques liées au domaine de la biochimie
• ARES. 3.1 Rédiger, présenter, discuter, et argumenter des rapports techniques et expérimentaux, protocoles, synthèses bibliographiques, résultats d’analyses, bilans, synthèses bibliographiques ou autres documents scientifiques sur base des données scientifiques et techniques actuellement disponibles (recherche de données pertinentes).
• ARES. 3.2 Sélectionner des matières premières ou nutriments, créer ou sélectionner une souche microbienne, une cellule animale, un vecteur, …, innover, améliorer, modéliser et schématiser des protocoles, modes opératoires, dispositifs d’analyse, des installations de « Up Stream Processing » ou « Down Stream Processing ».
• ARES. 3.4 Connaitre et évaluer les risques liés à l’utilisation d’organismes vivants éventuellement recombinés.
• ARES. 3.6 Respecter et faire respecter les législations et réglementations en vigueur, les normes et les procédures en termes d’assurance qualité, d’hygiène, de biosécurité, de systèmes de certification, et ce au travers par exemple des bonnes pratiques GMP/GLP, des normes internationales ISO ou européennes EN, des règles de biosécurité relative par exemple à l’utilisation d’OGM et/ou d’organismes pathogènes, de protection des travailleurs exposés à des agents biologiques au travail, de normes HACCP, ...Assurer la production en respectant le cahier des charges (spécifications), les coûts et les délais.
• ARES. 4 04. S’intégrer et contribuer au développement de son milieu professionnel
• ARES. 4.3 Travailler en autonomie et en équipe dans le respect de la culture d’entreprise
• ARES. 7 07. S’engager dans une démarche de développement professionnel
• ARES. 7.2 S’autoévaluer pour identifier ses besoins de développement
• ARES. 7.4 Organiser son savoir de manière à améliorer son niveau de compétence

Autres connaissances ou compétences prérequises :

Microbiologie 2

• Cours de Biologie, de Biochimie et de Microbiologie de Bachelier.

Laboratoire de microbiologie 2

• Cours de Biologie, de Biochimie et de Microbiologie de Bachelier.

Descriptif des objectifs et des contenus de l’UE :

Microbiologie 2

Objectifs :

• - Étudier et comprendre la cytologie (cf. structures et composition), la physiologie et la biochimie (moléculaire et cellulaire) des micro-organismes à travers « leur visite guidée ».
  - Étudier les méthodes de contrôle microbiologique.
  - Illustrer l’intérêt des micro-organismes en recherche fondamentale, en recherche appliquée, dans les bio-industries et les biotechnologies, ...
  - Acquérir et intégrer les différents concepts de la Microbiologie (moléculaire et cellulaire), pré requis indispensable à la compréhension des cours de Génie génétique, de Biochimie appliquée, de Génie biochimique, de Biochimie industrielle, …

Contenu :

• - Bio-industries et biotechnologies.
  - Diversité microbienne, taxinomie microbienne, classification sécuritaire, …
  - Bactéries et levures : cytologie (membrane, paroi, capsule, LPS, cytoplasme, périplasme, flagelles, pili, matériel génétique, …), physiologie, biochimie (moléculaire et cellulaire), …
  - La sporulation, les biofilms, les antibiotiques, ...
  - Les méthodes de contrôle microbiologique (stérilisation, désinfection, antiseptisation, aseptisation).

Laboratoire de microbiologie 2

Objectifs :

• - Illustrer le cours théorique de Microbiologie 2.
  - Former les étudiants au respect des consignes de biosécurité et les familiariser aux techniques classiques de Microbiologie conduisant à l’isolement, au dénombrement et à l’identification (sommaire, cf. genre) des micro-organismes (bactéries, levures) de classe de sécurité biologique 1.
  - Former les étudiants à être autonome au sein d’un laboratoire de Microbiologie au point de vue organisationnel (gestion de son travail, du matériel et des produits).
  - Former les étudiants à l’analyse microbiologique (et les sensibiliser aux nombreux contrôles à effectuer), à l’expression des résultats et à l’interprétation rigoureuse de ceux-ci (cf. rédaction de rapports).
  - Acquérir une démarche de pensée logique, analytique, pertinente et rigoureuse ; et développer son autonomie et son esprit critique dans la résolution de problèmes.

Contenu :

• - Préparation et stérilisation du matériel, des milieux de culture et de divers réactifs.
  - Manipulations aseptiques (en L1) : prélèvements, transferts, dilutions sériées, …
  - Mises en culture, enrichissements sélectifs, isolements de souches pures au départ d’un échantillon complexe.
  - Observations macroscopiques et caractérisation de colonies sur milieux gélosés.
  - Observations microscopiques et caractérisation sommaires des micro-organismes (cf. genre) : état frais, colorations négatives vs différentielles, … manipulation du microscope.
  - Tests enzymatiques et biochimiques (sommaires) : galeries API, milieux chromogènes, …
  - Mise en évidence des contaminants de l’air, de l’eau, de la terre, de la peau, de la salive, …
  - Comptages de micro-organismes (totaux vs viables vs vivants) : méthodes directe vs indirecte.

Activités et méthodes d’apprentissage et d’enseignement :

Microbiologie 2

• - L’enseignement est principalement de type magistral : exposé verbo-iconique (supporté par une projection de présentations PowerPoint).
  - Méthode interactive : une participation active à chaque séance du cours est vivement recommandée.

Laboratoire de microbiologie 2

• - Une introduction repositionnant la manipulation dans son contexte théorique est réalisée en début de chaque séance.
  - Les étudiants réalisent, individuellement, les manipulations précitées sur base des protocoles présentés dans le syllabus (préparation à domicile).
  - Démonstrations pratiques.
  - Le titulaire des TP passe « d’étudiant en étudiant ».

Acquis d’apprentissages sanctionnés, spécifiques et contribuant à l’UE :

Microbiologie 2

• A l'issue du cours de Microbiologie 2, l'étudiant est capable de :
  - De s’approprier les savoirs théoriques de la Microbiologie (moléculaire et cellulaire) et d’en maîtriser sa terminologie.
  - De décrire et d’expliquer la cytologie (cf. structures et composition), la physiologie, la biochimie, la sporulation, la génétique des micro-organismes.
  - De comprendre et d'expliquer les méthodes de contrôle microbiologique.
  - D’illustrer l’intérêt des micro-organismes en recherche fondamentale, en recherche appliquée, dans les bio-industries et les biotechnologies, ...
  - De transposer les données du cours dans des situations plus appliquées (telles les TP de laboratoire, le contrôle « Qualité », la recherche fondamentale vs appliquée, l’industrie …).

Laboratoire de microbiologie 2

• A l'issue des laboratoires de Microbiologie 2, l'étudiant est capable de :
  - De s’approprier les savoirs pratiques de la Microbiologie et d’en maîtriser sa terminologie.
  - De préparer, stériliser et conditionner différents milieux de culture (qualitativement et quantitativement simples vs complexes), réactifs et matériels utilisés dans les techniques microbiologiques de base.
  - De travailler de manière aseptique : prélèvements, dilutions sériées, transferts, ensemencements (en surface, dans la masse, en double couche).
  - De procéder à l’examen macroscopique de colonies sur différents milieux gélosés (taille, forme, coupe, couleur, aspect, texture, …).
  - De procéder à l’examen microscopique complet d’une souche pure de classe 1 (état frais, coloration négative, coloration différentielle de Gram) : forme, taille, mode d’association, groupe taxinomique.
  - De procéder au dénombrement d’une population microbienne (vivante vs viable vs totale) par des méthodes directe (cf. chambre de comptage) et indirecte (cf. ensemencements). Validation des duplicatas, des dilutions sériées, de l’écart type, de l’intervalle de confiance, … Expression des résultats.
  - D’isoler une souche pure au départ d’une flore hétérogène complexe (cf. milieux sélectifs, facteurs physico-chimiques).
  - De caractériser (cf. genre) biochimiquement une souche bactérienne pure via, notamment, une méthode commerciale de type galerie API.
  - De réaliser de manière autonome une expérience sur base du protocole fourni.
  - De présenter de manière adéquate les résultats expérimentaux obtenus, de les analyser de manière rigoureuse et pertinente et de les interpréter en regards des résultats théoriques attendus. Validation des contrôles positifs et négatifs. Étude des effets croisés de : la T°, +/- O2, de la disponibilité en nutriments, du temps d’exposition, …
  - De présenter une communication écrite de qualité.

Description des supports de cours indispensables :

Description des références et des supports :

Mode d’évaluation et de pondération par activité au sein de l’UE :